Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC5Q00444 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms