Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2BQ00403 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2BQ00403 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms