Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTBP60709 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTBP60709 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTBP60709 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms