Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCDC1P59894 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCDC1P59894 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DCDC1P59894 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DCDC1P59894 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCDC1P59894 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCDC1P59894 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCDC1P59894 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCDC1P59894 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCDC1P59894 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DCDC1P59894 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCDC1P59894 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCDC1P59894 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCDC1P59894 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCDC1P59894 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCDC1P59894 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCDC1P59894 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCDC1P59894 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCDC1P59894 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCDC1P59894 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCDC1P59894 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCDC1P59894 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DCDC1P59894 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DCDC1P59894 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DCDC1P59894 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCDC1P59894 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCDC1P59894 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCDC1P59894 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCDC1P59894 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCDC1P59894 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCDC1P59894 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCDC1P59894 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms