Protein–RNA interactions for Protein: P52907

CAPZA1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA1P52907 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAPZA1P52907 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAPZA1P52907 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms