Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2A1P52655 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms