Protein–RNA interactions for Protein: P51795

CLCN5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN5P51795 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCN5P51795 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms