Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms