Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCAMP43121 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCAMP43121 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MCAMP43121 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCAMP43121 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MCAMP43121 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCAMP43121 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCAMP43121 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MCAMP43121 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCAMP43121 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MCAMP43121 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCAMP43121 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MCAMP43121 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MCAMP43121 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MCAMP43121 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCAMP43121 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MCAMP43121 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCAMP43121 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MCAMP43121 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MCAMP43121 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCAMP43121 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MCAMP43121 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MCAMP43121 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MCAMP43121 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MCAMP43121 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MCAMP43121 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MCAMP43121 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCAMP43121 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MCAMP43121 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCAMP43121 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCAMP43121 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCAMP43121 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MCAMP43121 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MCAMP43121 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms