Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms