Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4BPBP20851 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C4BPBP20851 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4BPBP20851 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C4BPBP20851 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4BPBP20851 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C4BPBP20851 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4BPBP20851 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C4BPBP20851 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4BPBP20851 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C4BPBP20851 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4BPBP20851 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
C4BPBP20851 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C4BPBP20851 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4BPBP20851 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4BPBP20851 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C4BPBP20851 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
C4BPBP20851 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4BPBP20851 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4BPBP20851 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C4BPBP20851 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C4BPBP20851 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C4BPBP20851 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C4BPBP20851 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C4BPBP20851 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C4BPBP20851 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C4BPBP20851 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4BPBP20851 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4BPBP20851 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
C4BPBP20851 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4BPBP20851 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4BPBP20851 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C4BPBP20851 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms