Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT10P13645 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT10P13645 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT10P13645 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT10P13645 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT10P13645 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT10P13645 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT10P13645 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT10P13645 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT10P13645 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT10P13645 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT10P13645 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT10P13645 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT10P13645 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT10P13645 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT10P13645 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT10P13645 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT10P13645 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT10P13645 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT10P13645 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT10P13645 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT10P13645 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT10P13645 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT10P13645 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT10P13645 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT10P13645 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT10P13645 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT10P13645 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT10P13645 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT10P13645 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT10P13645 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT10P13645 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT10P13645 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT10P13645 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT10P13645 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT10P13645 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT10P13645 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT10P13645 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT10P13645 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT10P13645 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT10P13645 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT10P13645 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT10P13645 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT10P13645 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT10P13645 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT10P13645 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT10P13645 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT10P13645 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT10P13645 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT10P13645 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT10P13645 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT10P13645 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT10P13645 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT10P13645 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT10P13645 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT10P13645 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT10P13645 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT10P13645 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT10P13645 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT10P13645 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT10P13645 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT10P13645 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT10P13645 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT10P13645 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT10P13645 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT10P13645 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms