Protein–RNA interactions for Protein: P0CG23

ZNF853, Zinc finger protein 853, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF853P0CG23 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF853P0CG23 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms