Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFLP07196 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFLP07196 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFLP07196 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFLP07196 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFLP07196 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFLP07196 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFLP07196 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFLP07196 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFLP07196 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFLP07196 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFLP07196 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFLP07196 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFLP07196 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFLP07196 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFLP07196 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFLP07196 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFLP07196 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFLP07196 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFLP07196 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFLP07196 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFLP07196 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFLP07196 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFLP07196 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFLP07196 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFLP07196 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFLP07196 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFLP07196 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFLP07196 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFLP07196 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFLP07196 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFLP07196 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFLP07196 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFLP07196 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFLP07196 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFLP07196 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFLP07196 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFLP07196 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFLP07196 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFLP07196 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFLP07196 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFLP07196 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFLP07196 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFLP07196 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFLP07196 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFLP07196 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFLP07196 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFLP07196 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFLP07196 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFLP07196 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFLP07196 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFLP07196 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFLP07196 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFLP07196 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFLP07196 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFLP07196 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFLP07196 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFLP07196 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFLP07196 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFLP07196 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFLP07196 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFLP07196 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFLP07196 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFLP07196 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFLP07196 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFLP07196 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFLP07196 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFLP07196 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFLP07196 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFLP07196 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFLP07196 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFLP07196 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFLP07196 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFLP07196 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFLP07196 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFLP07196 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFLP07196 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFLP07196 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFLP07196 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFLP07196 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFLP07196 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFLP07196 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFLP07196 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFLP07196 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFLP07196 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFLP07196 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFLP07196 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFLP07196 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFLP07196 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFLP07196 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFLP07196 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFLP07196 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFLP07196 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFLP07196 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFLP07196 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFLP07196 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFLP07196 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFLP07196 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFLP07196 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFLP07196 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms