Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCN2BO60939 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms