Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms