Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLIN1O60240 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms