Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms