Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QRK9 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
J3QRK9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QRK9 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QRK9 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms