Protein–RNA interactions for Protein: H3BMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BMQ9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H3BMQ9 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3BMQ9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3BMQ9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3BMQ9 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3BMQ9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3BMQ9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3BMQ9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3BMQ9 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3BMQ9 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3BMQ9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3BMQ9 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H3BMQ9 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H3BMQ9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H3BMQ9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3BMQ9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3BMQ9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3BMQ9 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3BMQ9 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3BMQ9 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3BMQ9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3BMQ9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms