Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP17L13C9JLJ4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP17L13C9JLJ4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP17L13C9JLJ4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP17L13C9JLJ4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP17L13C9JLJ4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP17L13C9JLJ4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP17L13C9JLJ4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP17L13C9JLJ4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms