Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J203

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J203 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0B4J203 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms