Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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