Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF2Q9UG63 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms