Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP35Q9P2H5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
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