Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms