Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVK-5Q9HDB9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms