Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB11FIP5Q9BXF6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms