Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MYCBPQ99417 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MYCBPQ99417 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms