Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMTK3Q96Q04 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMTK3Q96Q04 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms