Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C9orf85Q96MD7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms