Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGBD1Q96JS3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGBD1Q96JS3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGBD1Q96JS3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGBD1Q96JS3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGBD1Q96JS3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGBD1Q96JS3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGBD1Q96JS3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGBD1Q96JS3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGBD1Q96JS3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGBD1Q96JS3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PGBD1Q96JS3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGBD1Q96JS3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PGBD1Q96JS3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PGBD1Q96JS3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PGBD1Q96JS3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PGBD1Q96JS3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PGBD1Q96JS3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PGBD1Q96JS3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PGBD1Q96JS3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PGBD1Q96JS3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PGBD1Q96JS3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PGBD1Q96JS3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PGBD1Q96JS3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGBD1Q96JS3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms