Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRG4Q92954 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRG4Q92954 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms