Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RFPL4BQ6ZWI9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms