Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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