Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB0

VWA1, von Willebrand factor A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA1Q6PCB0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA1Q6PCB0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms