Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM208BQ5VWN6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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FAM208BQ5VWN6 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM208BQ5VWN6 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM208BQ5VWN6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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FAM208BQ5VWN6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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FAM208BQ5VWN6 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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FAM208BQ5VWN6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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FAM208BQ5VWN6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM208BQ5VWN6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM208BQ5VWN6 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM208BQ5VWN6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM208BQ5VWN6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM208BQ5VWN6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM208BQ5VWN6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM208BQ5VWN6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM208BQ5VWN6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM208BQ5VWN6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM208BQ5VWN6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM208BQ5VWN6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM208BQ5VWN6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM208BQ5VWN6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM208BQ5VWN6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM208BQ5VWN6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM208BQ5VWN6 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM208BQ5VWN6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM208BQ5VWN6 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM208BQ5VWN6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM208BQ5VWN6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM208BQ5VWN6 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM208BQ5VWN6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM208BQ5VWN6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM208BQ5VWN6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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