Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBRG1Q3YBR2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms