Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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RRN3P1Q2M238 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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RRN3P1Q2M238 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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RRN3P1Q2M238 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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