Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MSMPQ1L6U9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSMPQ1L6U9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms