Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PFKFB3Q16875 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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