Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCK2Q16822 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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