Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDK4Q16654 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms