Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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NEDD8Q15843 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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NEDD8Q15843 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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NEDD8Q15843 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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NEDD8Q15843 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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NEDD8Q15843 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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NEDD8Q15843 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NEDD8Q15843 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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