Protein–RNA interactions for Protein: Q156A1

ATXN8, Ataxin-8, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8Q156A1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATXN8Q156A1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms