Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL9A2Q14055 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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