Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK13Q14004 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK13Q14004 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
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