Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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KCNC3Q14003 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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KCNC3Q14003 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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KCNC3Q14003 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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KCNC3Q14003 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNC3Q14003 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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