Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOFQ13790 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOFQ13790 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOFQ13790 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOFQ13790 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOFQ13790 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOFQ13790 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOFQ13790 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOFQ13790 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOFQ13790 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOFQ13790 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOFQ13790 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APOFQ13790 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOFQ13790 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOFQ13790 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOFQ13790 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APOFQ13790 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOFQ13790 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOFQ13790 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOFQ13790 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOFQ13790 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOFQ13790 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOFQ13790 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOFQ13790 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOFQ13790 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOFQ13790 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOFQ13790 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOFQ13790 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOFQ13790 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOFQ13790 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOFQ13790 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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