Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
RIPPLY1Q0D2K3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms